基于同源重组的过表达载体构建
P3×FLAG-CMV14-TRIM26质粒构建
1. 载体信息
载体:p3×FLAG-CMV14(C端FLAG),分子量6310bp,图谱如下:
选择酶切位点:EcoR I: GAATTC;BamH I:GGATCC
2. 引物设计
引物设计,因为选择的方法是无缝克隆(同源重组)的方法,所以在引物两端分别加上15bp左右的同源臂(多克隆位点不算在内),加上酶切位点;同时,FLAG标签是C端的,所以下游引物基因的终止密码子应该去除。引物序列如下:
CMV-26F-F: TAAGCTTGCGGCCGCGAATTCATGGCCACGTCAGCCCCA
CMV-26F-R: TTTGTAGTCAGCCCGGGATCCGGGTCTTAGCAGGAGGCG
3. PCR
PCR反应体系如下:
组分 | 体积 |
---|---|
ddH2O | 7.5 |
2Xbuffer | 10 |
CMV-26F-F(10 nM) | 0.5 |
CMV-26F-R(10 nM) | 0.5 |
DNA模板 | 1 |
酶 | 0.5 |
程序:
98℃,3 min –> | 98℃,30s –> 60℃,30s –> 72℃,1 min (30 cycle)|–> 72℃,5 min –> 4℃,∞
4. 载体酶切
酶切体系:
组分 | 体积 |
---|---|
ddH2O | 14.6 |
Buffer FD | 2 |
EcoR I | 1 |
BamH I | 1 |
载体 | 1.4(2 ug) |
同时,分别做两个10uL体系的单酶切。跑胶的时候可以把环状质粒作为对照。跑完胶后用胶回收试剂盒进行回收,用20 uLddH2O溶解回收片段。
5. 同源重组
使用碧云天的无缝克隆试剂盒,反应体系如下:
组分 | 体积 |
---|---|
PCR片段 | 1.25 |
酶切好的载体 | 1.25 |
2X seamless cloning Mix | 2.5 |
总体积 | 5 uL |
50℃金属浴,反应15 min。然后转化涂板。
6. 菌落PCR验证
涂板后12~16小时,挑取单克隆,于10 uL无菌ddH2O中混匀。每个板挑取5个左右的菌落进行PCR验证。可以使用回收的PCR产物作为阳性对照。
PCR验证后,取其中一个中提质粒,测序。
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