P3×FLAG-CMV14-TRIM26质粒构建

1. 载体信息

载体:p3×FLAG-CMV14(C端FLAG),分子量6310bp,图谱如下:

image-20220710154139618

选择酶切位点:EcoR I: GAATTC;BamH I:GGATCC

2. 引物设计

引物设计,因为选择的方法是无缝克隆(同源重组)的方法,所以在引物两端分别加上15bp左右的同源臂(多克隆位点不算在内),加上酶切位点;同时,FLAG标签是C端的,所以下游引物基因的终止密码子应该去除。引物序列如下:

CMV-26F-F: TAAGCTTGCGGCCGCGAATTCATGGCCACGTCAGCCCCA

CMV-26F-R: TTTGTAGTCAGCCCGGGATCCGGGTCTTAGCAGGAGGCG

3. PCR

PCR反应体系如下:

组分 体积
ddH2O 7.5
2Xbuffer 10
CMV-26F-F(10 nM) 0.5
CMV-26F-R(10 nM) 0.5
DNA模板 1
0.5

程序:

98℃,3 min –> | 98℃,30s –> 60℃,30s –> 72℃,1 min (30 cycle)|–> 72℃,5 min –> 4℃,∞

4. 载体酶切

酶切体系:

组分 体积
ddH2O 14.6
Buffer FD 2
EcoR I 1
BamH I 1
载体 1.4(2 ug)

同时,分别做两个10uL体系的单酶切。跑胶的时候可以把环状质粒作为对照。跑完胶后用胶回收试剂盒进行回收,用20 uLddH2O溶解回收片段。

2022 -7-09 pcmv14-26PCR PCR和载体酶切

5. 同源重组

使用碧云天的无缝克隆试剂盒,反应体系如下:

组分 体积
PCR片段 1.25
酶切好的载体 1.25
2X seamless cloning Mix 2.5
总体积 5 uL

50℃金属浴,反应15 min。然后转化涂板。

2022-07-10 p3×FLAG-CMV14-TRIM26 涂板

6. 菌落PCR验证

涂板后12~16小时,挑取单克隆,于10 uL无菌ddH2O中混匀。每个板挑取5个左右的菌落进行PCR验证。可以使用回收的PCR产物作为阳性对照。

2022-07-10 p3×FLAG-CMV14-TRIM26 PCR验证

PCR验证后,取其中一个中提质粒,测序。