流式细胞软件FlowJo学习笔记

1. Copy analysis to group

 设置好对照组的门或者十字门之后，右键选择copy analysis to group，就可以把设置的门应用到所有的样本中去了，而且条件是一致的。

2. 调节坐标轴参数

 打开一张图，可以看到横坐标和纵坐标都有一个T，点击T –> Customize axis…

 Scale选择log或线性，点击上面的加号或减号就可以调整坐标轴的始末大小了，然后点击apply即可。

3. 设置细胞凋亡双染四个象限的颜色

 选择Layout（这是一个很有用的功能，排版布局很方便，也有一些很炫的操作），将双染的图和各个象限的图一次拖到layout的界面中，就可以显示出不同象限不同颜色的图了，然后自己可以根据需求调整颜色。

 其中，上面有一个create batch report的按键，可以一键将所有的样本（设门后的图）批量绘制成上图的效果；而且，更改原图的设置后，layout中的图也会相应的更新，再也不用担心图片调来调去的麻烦了，省时省力省心

 FlowJo使用2天的心得，由于样本的问题（不知道怎么做用来做单染的阳性样本），没有尝试补偿这方面的内容，以后再摸索。还有细胞周期，FlowJo也是可以分析的。